经典错误解决不了：openmp中segmentation fault

主题：经典错误解决不了：openmp中segmentation fault

baccle [专家分：190] 发布于 2011-07-13 15:41:00

程序串行时没有错误，一加上openmp并行后就运行不了，报错是
/var/spool/torque/mom_priv/jobs/6127.node1.SC: line 11: 629 Segmentation fault
上网查了一下这个错误的原因，然后做了以下这些

1.在工作目录下找到.bashrc文件，加入语句export STACKSIZE=500M
2.在提交任务的脚本中加入语句 export STACSIZE=500M
3.在SSH页面上运行ulimit -s 500000
4.在openmp并行区，把比较大的数组都改成了动态数组

不过都没用，还是同样的错误，不知道该怎么办了，上来请教高手们
谢谢！！！

（用的是gfortran编译器，曙光集群）

本帖地址： http://bbs.pfan.cn/post/370652.html

回复列表（共23个回复）

沙发

cgl_lgs [专家分：21040] 发布于 2011-07-13 16:03:00

编译选项是啥？如果有-march=XXX,那就试试改成-march=i686

板凳

baccle [专家分：190] 发布于 2011-07-14 10:41:00

编译选项是 -O3，-ftree-vectorize -fopenmp,你说的改的-march=XXX是什么意思呢，看了你们以前的帖子知道是线程堆栈的问题，可是怎么解决呢？
谢谢哈

3 楼

yeg001 [专家分：14390] 发布于 2011-07-14 11:27:00

1. 确定不是代码问题?
2. 集群上怎么用omp?(我对曙光集群不了解)

4 楼

baccle [专家分：190] 发布于 2011-07-14 11:37:00

代码肯定没问题，在个人机的window下运行8个线程一点问题都没有，在曙光上运行是用它的一个节点，就相当于是一台电脑。

5 楼

yeg001 [专家分：14390] 发布于 2011-07-14 13:12:00

在一个节点上确实是相当于一个电脑.
我遇到过一种情况, 就是某个节点的内存被其他人使用得差不多没有的时候, omp也是提示出错. 不知道曙光可不可以查看该程序当前所在节点的资源情况?

6 楼

cgl_lgs [专家分：21040] 发布于 2011-07-14 14:49:00

gcc是啥版本捏？用董兄编译的版本试试看看行不行？

7 楼

dongyuanxun [专家分：7180] 发布于 2011-07-14 15:43:00

[quote]gcc是啥版本捏？用董兄编译的版本试试看看行不行？[/quote]
我没出Linux版

8 楼

dongyuanxun [专家分：7180] 发布于 2011-07-14 15:47:00

另外，环境变量名字对么
记得名字是OMP_STACKSIZE和GOMP_STACKSIZE

9 楼

dongyuanxun [专家分：7180] 发布于 2011-07-14 15:49:00

另外Segmentation fault也有可能是其他错误
需要gdb自己调试

10 楼

baccle [专家分：190] 发布于 2011-07-15 17:05:00

这个节点是我独享的，应该不会出现这种情况

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