DataGridViewCheckBoxColumn有个很大的bug，就是当我们选中它由False变为True的时候，在它的所有事件中，它都不能识别该Cell的Value为True!
即当我们选中该Cell后，第1时间得到的该值为：
dgView1.Rows(i).Cells(1).Value = False
不过在DataGridView.CurrentCellDirtyStateChanged事件中增加以下语句：
DataGridView.CommitEdit 
问题即可解决。

引自msdn:

通常，复选框单元格值专门用于存储（如同其他任何数据一样）或用于执行批量操作。如果您想在用户单击复选框单元格时立即作出响应，可以处理 DataGridView.CellClick 事件，但此事件发生在单元格值更新之前。如果在单击时需要新的值，则有一个选项可以计算基于当前值的预期值。另一种方法是立即提交更改，并处理 DataGridView.CellValueChanged 事件以对此作出响应。要在单击单元格时提交更改，必须处理 DataGridView.CurrentCellDirtyStateChanged 事件。在处理程序中，如果当前单元格是复选框单元格，将调用 DataGridView.CommitEdit 方法并传入 Commit 值。

所以，楼上所述的情况并不是bug，只是事件发生的时间和你想象中不一致。