有.DS_Store，可能是原作者在Mac OS下生成的
makefile里已经写明编译顺序为OccamModules.f90 MT2DModules.f90 Occam.f90 MT2D.f90，
所以要把前两个OccamModules.f90 MT2DModules.f90先编译成.mod
后两个再编译成.o或.obj
然后把.o 和 .mod进行链接输出可执行程序或库
对于cvf，生成了.mod就可以直接使用use了
如何用cvf只编译不链接，请参见cvf命令行的使用

我测试了下，makefile可用，编译没问题。说明四个文件都没问题，你还是检查下你的项目设置吧。
这是windows下，ifort，makefile文件

FC90 = ifort
FCFLAGS= -O2
rm = DEL
TARGETS= clean  Occam2D

OBJSOC= OccamModules.f90 MT2DModules.f90 Occam.f90 MT2D.f90
        
all:  $(TARGETS)

clean:
        $(rm)  *.o *~ core *.mod
        $(rm)  Occam2D

Occam2D:$(OBJSOC)
        $(FC90) $(FCFLAGS) -o $@ $(OBJSOC)  $(LIBS)

# General compile rules

.SUFFIXES: .f90 .o 

.f90.o:    
    $(FC90) $(FCFLAGS)    -c -o $@ $<

晕，MT2D  OCCAM反演

这个我编译过，没问题