你的想法很好，这个东西是典型的MIS（Managment Information System）系统，MIS和普通的业务处理最根本的差别就越是MIS要体现管理的思想，用流程来控制生产。而普通的处理系统仅完成数据的采集和汇总。
不过我给你的建议是
1）先不要考虑任何关于数据库的问题，任何类型的关系数据库都可以实现的
2）了解业务流程，并将他画出来
3）第二步是将业务流程转换成逻辑流程，即用一些规定的符号来表示各个实体、关系和处理
4）根据以上的流程在再编程序，SQL是一个很好的选择，因为这种多部门使用的数据库一定会涉及数据的同步和更新的问题，使用单独的数据库服务器是一个理想的选择。

ERP---Enterprise Resource Planning(企业资源计划),這個有現成的,但不知樓主需要哪個行業ERP,若有需要,可以聯系.

搞这个东西重要的是数据流程，如果数据流程没搞清，或是漏了什么，做出来的东西一定没人愿意用。